管家基因反应体系: 序号 反应物 剂量 1 SYBR Green 1 染料 10μl 2 内参照上游引物F 0.5μl 3 内参照下游引物R 0.5μl 4 dNTP 0.5μl 5 Taq酶 1μl 6 待测样品cDNA 5μl 7 ddH2O 32.5μl 8 总体积 50μl 轻弹管底将溶液混合,6000rpm短暂离心。
制备好的阳性标准品和检测样本同时上机,反应条件为:93℃2分钟,然后93℃ 1分钟,55℃ 2分钟,共40个循环。 针对每一需要测量的基因,选择一确定表达该基因的cDNA模板进行PCR反应。
反应体系: 序号 反应物 剂量 1 10×PCR缓冲液 2.5 ul 2 MgCl2溶液 1.5 ul 3 上游引物F 0.5 ul 4 下游引物R 0.5 ul 5 dNTP混合液 3 ul 6 Taq聚合酶 1 ul 7 cDNA 1 ul 8 加水至总体积为 25ul 轻弹管底将溶液混合,6000rpm短暂离心。
35个PCR循环(94℃1分钟;55℃1分钟;72℃1分钟); 72℃延伸5分钟。
PCR产物与 DNA Ladder在2%琼脂糖凝胶电泳,溴化乙锭染色,江苏病原微生物荧光定量PCR检测服务,检测PCR产物是否为单一特异性扩增条带。
将PCR产物进行10倍梯度稀释: 设定PCR产物浓度为1×1010,依次稀释至109,江苏病原微生物荧光定量PCR检测服务,江苏病原微生物荧光定量PCR检测服务、108、107、106、105、104几个浓度梯度。 所有cDNA样品分别配置实时定量 PCR反应体系。
无论 Ct ***值是多少,任何能够有效扩增和检测起始模板拷贝数为 1 的系统都达到了灵敏度的极限。
如前文所述,效率是决定反应灵敏度的关键因素(图 5)。在检测极低拷贝数时的另一个重要的考虑因素是,不能预期模板为正态分布。相反,它会遵循泊松分布,该分布预测在平均包含一个拷贝的起始模板的大量重复中,实际上约 37% 不含拷贝,*有约 37% 含有 1 个拷贝,18% 应包含 2 个拷贝(见图 9)。因此,为了可靠地检测低拷贝,必须做大量的重复实验来提供统计***性,以克服泊松分布的限制。
***定量:用已知的标准曲线对未知样本的量进行推算的方法为***定量法。此种方法需要明确标准样品的浓度情况,然后稀释标准样品,分为几个不同梯度浓度然后进行反应测试。横坐标为标准品拷贝数的对数值,纵坐标为测得的Ct值,进而绘制出标准曲线。以标准曲线为基础,在定量分析未知样品过程中根据其ct值能够将样起始拷贝数推算出
实时荧光定量PCR技术总结为以下几点。特异性强 灵敏度高 重复性好 检测速度快 自动化程度高
实时荧光定量PCR具有灵敏度高、特异性高和精确性高的优点,此项技术已被应用于分子生物学、医学、食品检测和环境监测等多个领域
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