荧光定量PCR 实验步骤(1)
样品RNA的抽提
①取冻存已裂解的细胞,室温放置5分钟使其完全溶解。
②每样品加入1ml的TRIZOL试剂裂解,盖紧管盖。手动剧烈振荡管体15秒后,15到30℃孵育2到3分钟。4℃下12000rpm离心15分钟。离心后混合液体将分为下层的红色酚相,中间层以及无色水相上层。RNA全部被分配于水相中。水相上层的体积大约是匀浆时加入的TRIZOL试剂的60%。
③RNA沉淀 将水相上层转移到一干净无RNA酶的离心管中。加等体积异丙醇混合以沉淀其中的RNA,混匀后15到30℃孵育10分钟后,于4℃下12000rpm 离心10分钟。此时离心前不可见的RNA沉淀将在管底部和侧壁上形成胶状沉淀块。
④RNA清洗 移去上清液,每1mlTRIZOL试剂裂解的样品中加入至少1ml的75%乙醇(75%乙醇用DEPCH2O配制),天津荧光定量PCR检测服务,清洗RNA沉淀。混匀后,4℃下7000rpm离心5分钟。
⑤RNA干燥 小心吸去大部分乙醇溶液,使RNA沉淀在室温空气中干燥5-10分钟,天津荧光定量PCR检测服务。
⑥溶解RNA沉淀 溶解RNA时,天津荧光定量PCR检测服务,先加入无RNA酶的水40μl用移液器反复吹打几次,使其完全溶解,获得的RNA溶液保存于-80℃待用。
SYBR Green I法:SYBR Green I是一种具有绿色激发波长的染料,比较大吸收波长约为 497 nm,发射波长比较大约为 520 nm,可以和所有的 dsDNA 双螺旋小沟区域结合。因为在游离状态下 SYBR Green I 发出的荧光较弱,但是当它与双链 DNA 结合后,荧光就会**增强,而且荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。此法的优点是它可以监测任何 dsDNA 序列的扩增,检测方法较为简单,成本较低,但也正是由于荧光染料能和任何dsDNA 结合,如非特异性扩增产物和引物二聚体也能与染料结合而产生荧光信号,使实验产生假阳性结果,因此其特异性不如探针法。因为非特异性产物和引物二聚体的变性温度要比目标产物的低,所以可以在熔解曲线反应过程中利用软件分析仪器收集到信号进行鉴别
在分子生物学领域的研究应用
用于单核苷酸多态性(SNP)检测分析:人们对疾病的易感性和对同一种******同一种疾病的效果是有差异性的,遗传物质DNA的多态性RELP,STR,ABO血型和SNP是个体差异的遗传基础。SNP在人类基因组中***存在,是人类可遗传变异中最常见的一种,在遗传性疾病的研究中具有重要意义
DNA甲基化检测:DNA甲基化是表观遗传学重要的标记信息,通过实时荧光定量PCR技术获得基因组甲基化水平数据对表观遗传学的时空特异性研究具有重要意义
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