纯度检测
RNA溶液的A260/A280的比值即为RNA纯度,比值范围1,江苏病原微生物荧光定量PCR分析服务.8到2.1。
变性琼脂糖凝胶电泳测定
制胶
1g琼脂糖溶于72ml水中,冷却至60℃,10 ml的10× MOPS电泳缓冲液和18 ml的37% 甲醛溶液(12.3 M)。
灌制凝胶板,预留加样孔至少可以加入25 μl溶液。胶凝后取下梳子,将凝胶板放入电泳槽内,加足量的1×MOPS电泳缓冲液至覆盖胶面几个毫米。
准备RNA样品
取3μgRNA,加3倍体积的甲醛上样染液,江苏病原微生物荧光定量PCR分析服务,加EB于甲醛上样染液中至终浓度为10μg/ml。加热至70℃孵育15分钟使样品变性,江苏病原微生物荧光定量PCR分析服务。
电泳
上样前凝胶须预电泳5min,随后将样品加入上样孔。5–6V/cm电压下2h,电泳至溴酚兰指示剂进胶至少2–3cm。
紫外透射光下观察并拍照 江苏病原微生物荧光定量PCR分析服务
实时荧光定量PCR具有灵敏度高、特异性高和精确性高的优点,此项技术已被应用于分子生物学、医学、食品检测和环境监测等多个领域 。在分子生物学领域的研究应用 定量核酸浓度:传统方法是用琼脂糖凝胶电泳或者分光光度计测定核酸浓度,其结果不准确而且易污染,实时荧光定量PCR可以解决这些问题,它的准确性、灵敏度高且无污染,对一些传染性疾病进行定量分析、病原微生物和***含量检测,此项技术都是优先
研究基因表达:应用实时定量PCR技术可以对基因时间、空间表达水平差异进行比较。例如,对特定基因用物理、化学、***等不同方法处理后的差异进行比较,为人们的科学研究提供依据 北京转基因荧光定量PCR分析服务
转基因:利用荧光定量PCR技术将转基因信号扩增放大。
在环境监测方面的应用实时荧光定量PCR技术已经被国内外应用在环境监测中,提高了监测水平。此项技术可以检测河流中环境微生物随着季节变化的情况。还可以用来对地表水和饮用水中致病菌进行检测以便及时预告地表水污染情况以及采取相应有效措施避免大范围污染
仪器摆放:实时荧光定量 PCR 仪应安放在湿度较低、灰尘较少、远离水池的平稳台面上,不能有强光直射,室内应通风良好,无腐蚀性气体
SYBR Green I法:SYBR Green I是一种具有绿色激发波长的染料,比较大吸收波长约为 497 nm,发射波长比较大约为 520 nm,可以和所有的 dsDNA 双螺旋小沟区域结合。因为在游离状态下 SYBR Green I 发出的荧光较弱,但是当它与双链 DNA 结合后,荧光就会**增强,而且荧光信号的增加与 PCR 产物的增加完全同步。此法的优点是它可以监测任何 dsDNA 序列的扩增,检测方法较为简单,成本较低,但也正是由于荧光染料能和任何dsDNA 结合,如非特异性扩增产物和引物二聚体也能与染料结合而产生荧光信号,使实验产生假阳性结果,因此其特异性不如探针法。因为非特异性产物和引物二聚体的变性温度要比目标产物的低,所以可以在熔解曲线反应过程中利用软件分析仪器收集到信号进行鉴别
为了正确地评估 PCR 效率,至少需要 3 次重复和至少 5 个数量级倍数的模板浓度。图 6 说了建议此精确级别的理由,它证明在 1 个数量级倍数与 5 个数量级倍数范围内测试稀释模板时,获得的斜率或效率可能产生数学偏差。因此,即使检测 ** 有效,由于每个稀释点都存在标准差,检测一个数量级倍数的连续稀释时,可能获得 70 至 170% 的范围。在 5 个数量级倍数范围内做相同数量的稀释点或重复,可能的偏移只有 ±8%。这意味着在 5 个数量级倍数范围内,如果效率为 94%,则该实验的效率范围介于 88% 到 ** 之间。为了准确测定 PCR 反应的效率,必须进行 5 个数量级倍数的连续稀释。-3.3 ±10% 的斜率意味着效率达到 ** ±±10%。PCR 反应效率越低,那么灵敏度越低。上海荧光定量PCR检测服务
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管家基因反应体系: 序号 反应物 剂量 1 SYBR Green 1 染料 10μl 2 内参照上游引物F 0.5μl 3 内参照下游引物R 0.5μl 4 dNTP 0.5μl 5 Taq酶 1μl 6 待测样品cDNA 5μl 7 ddH2O 32.5μl 8 总体积 50μl 轻弹管底将溶液混合,6000rpm短暂离心。
制备好的阳性标准品和检测样本同时上机,反应条件为:93℃2分钟,然后93℃ 1分钟,55℃ 2分钟,共40个循环。 针对每一需要测量的基因,选择一确定表达该基因的cDNA模板进行PCR反应。
反应体系: 序号 反应物 剂量 1 10×PCR缓冲液 2.5 ul 2 MgCl2溶液 1.5 ul 3 上游引物F 0.5 ul 4 下游引物R 0.5 ul 5 dNTP混合液 3 ul 6 Taq聚合酶 1 ul 7 cDNA 1 ul 8 加水至总体积为 25ul 轻弹管底将溶液混合,6000rpm短暂离心。
35个PCR循环(94℃1分钟;55℃1分钟;72℃1分钟); 72℃延伸5分钟。
PCR产物与 DNA Ladder在2%琼脂糖凝胶电泳,溴化乙锭染色,检测PCR产物是否为单一特异性扩增条带。
将PCR产物进行10倍梯度稀释: 设定PCR产物浓度为1×1010,依次稀释至109、108、107、106、105、104几个浓度梯度。 所有cDNA样品分别配置实时定量 PCR反应体系。 江苏病原微生物荧光定量PCR分析服务
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