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上海广谱不明原因病原 分析服务 **** 上海朝瑞生物科技供应

信息介绍 / Information introduction

④芽孢。芽孢是某些革兰氏阳性细菌在不利于生长的环境中形成的有抗性的休眠体,增强细菌抵抗外界不良环境的能力。能否杀灭芽孢是临床判断***成效的一项指征。5.细菌的致病物质细菌的致病物质主要包括细菌的菌体表面结构、侵袭性酶及***。菌体表面结构有两类,一类具有黏附作用的结构,如磷壁酸、多包被、菌毛等;另一类是具有抗吞噬作用的结构,如荚膜、微荚膜、A型链球菌的M蛋白,上海广谱不明原因病原 分析服务、金葡菌的A蛋白等。侵袭性酶是细菌合成分泌的胞外酶,一种有抗吞噬作用的酶,如金黄色葡萄球菌产生的血浆凝固酶,可在细菌周围形成纤维蛋白包裹层,抵抗人体吞噬细胞和补体,上海广谱不明原因病原 分析服务,上海广谱不明原因病原 分析服务、抗体的作用,保护细菌。另一种可帮助细菌在体内扩散的酶,如A型链球菌产生的透明质酸酶。细菌的***有内***和外***。上海广谱不明原因病原 分析服务

本研究将DNA-Seq结果与微生物耐***数据库进行比对,发现绝大部分不明原因肺炎患者的上呼吸道细菌中,均携带有大量的耐***基因,其中针对***Beta-lactam, Tetracycline和Macrolide的耐***基因数目**多。这些耐***基因***分布在多个细菌分类群中,而其中Bacteroidales, Lactobacillales, Pseudomonadales是主要的耐药基因来源宿主菌。在部分样本中,Streptococcus和A.baumannii的比例很高,而这些细菌中耐***基因比例同样很高,暗示细菌的耐***基因丰度可能与该细菌的菌群丰度呈现一定的相关关系,或许可以作为临床***的靶点。综上所述,本研究建立了基于NGS的宏基因组学病原检测和特征分析技术平台。利用该平台,我们对收集到的贵州省2013~2014年的不明原因肺炎样本进行了RNA-Seq深度测序。上海不明原因病原 筛查检测

    Singleprimerisothermalamplification,SPIA)对呼吸道病原鉴定的能力,结果显示SPIA扩增均一性和病原检测能力均优于MDA,可将其作为随后病原鉴定的扩增方法。我们将建立的这套基于NGS的宏基因组学病原检测方法用于33份2013-2014年贵州省排除了流感和SARS***后的不明原因肺炎病例病原研究,经过样本预处理和SPIA扩增,利用IonTorrent和IlluminaMiSeq两个平台进行RNA-Seq二代测序。经过宏基因组学分析,在16份样本中检测出了13种***,其中鼻***C的比例比较高。而且宏基因组学方法还可以获得***的全基因组序列信息进行进一步的进化和序列分析。对于RNA-Seq未能检测到呼吸道病原的17份样本,我们提取了样本DNA直接进行二代测序和宏基因组学分析。DNA-Seq未能在这些样本中发现DNA***,但微生物菌群分析显示,在这些患者的上呼吸道中分布着很高比例的Streptococcus。而在Streptococcus中,机会病原菌SStreptococcuspneumonia的比例比较高。不明原因肺炎病例往往经过******而无效。本研究将DNA-Seq结果与微生物耐***数据库进行比对,发现绝大部分不明原因肺炎患者的上呼吸道细菌中,均携带有大量的耐***基因,其中针对***Beta-lactam,Tetracycline和Macrolide的耐***基因数目**多。

    ①上呼吸道标本:包括咽拭子、鼻拭子、鼻咽抽取物、咽漱液、痰液。②下呼吸道标本:包括呼吸道抽取物、支气管灌洗液、胸水、肺组织活检标本。呼吸道标本应于发病早期即开始采集,根据病程决定采集的频次,采好的标本分装于3个螺口塑料试管中。(3)消化道标本。包括患者的呕吐物、粪便和肛拭子,应于发病早期即开始采集,根据病程决定采集的频次,采好的标本分装于3个螺口塑料试管中。(4)尿液。尿液采集中段尿,一般于发病早期采集,根据疾病的发展也可以进行多次采集,采集好的标本分装于3个螺口塑料试管中,取尿液或者沉淀物进行检测。(5)其它人体标本。包括脑脊液、疱疹液、淋巴结穿刺液、溃破组织、皮肤焦痂等。采集好的标本分装于3个螺口塑料试管中。(6)尸体解剖。对所有群体性不明原因疾病的死亡病例都应由当地卫生行政部门出面积极争取尸体解剖,尽可能采集死亡病例的所有组织***,如果无法采集所有组织,则应根据疾病的临床表现,采集与疾病有关的重点组织***标本(如肺、肝穿刺),以助病因诊断和临床救治。对于可能具有传染性的疾病,尸解时应根据可能的传播途径采取严格的防护措施。做病原学研究的组织标本采集得越早越好。

1.5.2 及时报告的原则报告单位和责任报告人应在发现群体性不明原因疾病2小时内以电话或传真等方式向属地卫生行政部门或其指定的专业机构报告,具备网络直报条件的机构应立即进行网络直报(参照《国家突发公共卫生事件相关信息报告管理工作规范》)。1.5.3 调查与控制并举的原则对群体性不明原因疾病事件的现场处置,应坚持调查和控制并举的原则。在事件的不同阶段,根据事件的变化调整调查和控制的侧重点。若流行病学病因(主要指传染源或污染来源、传播途径或暴露方式、易感人群或高危人群)不明,应以调查为重点,尽快查清事件的原因。对有些群体性不明原因疾病,特别是新发传染病暴发时,很难在短时间内查明病原的,应尽快查明传播途径及主要危险因素(流行病学病因),立即采取针对性的控制措施,以控制**蔓延。上海各类不明原因病原

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    报***或全国群体性不明原因疾病事件应急指挥部批准后实施。特别重大以下群体性不明原因疾病事件由地方各级人民**卫生行政部门组织**进行分析论证,提出终止应急反应的建议,报本级人民**批准后实施,并向上一级人民**卫生行政部门报告。上级人民**卫生行政部门,根据下级人民**卫生行政部门的请求,及时组织**对群体性不明原因疾病事件应急反应终止的分析论证提供技术指导和支持。评估资料的收集首先要有完善的群体性不明原因疾病暴发调查的程序和完整的工作记录,并及时将调查所得的资料进行整理归档,包括:报告记录;应急处置机构组织形式及成员单位名单;调查处理方案;调查及检验、诊断记录和结果材料;控制措施及效果评价材料;总结及其它调查结案材料等。评估的内容应急处置综合评估,包括事件概况、现场调查处理概况、患者救治概况、所采取的措施、效果评价和社会心理评估等,总结经验、发现调查中存在的不足,提高以后类似事件的应急处置能力,并为指导其他地区开展类似防制工作提供有益的经验。群体性不明原因疾病应急处置方案保障编辑技术保障群体性不明原因疾病**组各级卫生行政部门应成立群体性不明原因疾病**组。上海广谱不明原因病原 分析服务

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