使用包含 3 种不同浓度的 ROX 染料的预混液对 TGF-β 进行扩增。显示 (A) Ct 值和 (B) 标准差随 ROX 染料浓度的变化。降低 ROX 染料浓度导致 Ct 出现得更早,但是会增大标准差。使用 Applied Biosystems 7500 实时荧光定量 PCR 系统执行所有扩增。
Ct 随 PCR 效率发生变化。蓝色标准曲线的效率为 **(斜率为 –3.3),天津siRNA荧光定量PCR实验技术服务。绿色标准曲线的效率为 78%(斜率为 –4),天津siRNA荧光定量PCR实验技术服务。与高效率条件相比(蓝色),天津siRNA荧光定量PCR实验技术服务,在低效率条件下(绿色),扩增量 Y 使 Ct 出现得更早。较低扩增量 (X) 时则情况相反,与高效率条件(蓝色)相比,低效率条件(绿色)使 Ct 出现得更晚。 天津siRNA荧光定量PCR实验技术服务
实时荧光定量常用Taqman探针法和SYBR Green I法两类。
1.TaqMan探针法
TaqMan 探针法是具有高度特异性的定量PCR技术。它的工作原理为有一对 PCR 引物和一条探针存在于PCR 反应体系中,有荧光淬灭基团存在于3′
端标记,有报告基团存在于探针的5′ 端标记,探针*和模板特异结合,两条引物之间是其结合点。因此信号仪器搜集不到,伴随反应的进展,探针在外切核酸酶的活性的作用下被切断,从而造成淬灭基团不能吸收基团的荧光能量,从而使荧光信号产生,所以模板 DNA 的拷贝数取决于信号的强度。
2.SYBR Green I法
SYBR Green I为一种具有绿色激发波长的染料,其发射波长比较大约为 520 nm,比较大吸收波长约为 497 nm,能够结合所有的双螺旋小沟区域。由于处于游离状态,SYBR Green I发出的荧光较弱,然而其结合双链 DNA之后,就会使得荧光**增强,荧光信号的增加完全同步PCR 产物的增加。 北京临床疾病荧光定量PCR课题承包
温度设置:在设置荧光 PCR 程序时,要仔细核对程序中的目标温度、恒温时间和循环次数等参数,参数设置不正确将直接影响 PCR 检测结果。延伸过程中要设置读取收集荧光信号,如不设置收集荧光,将无法保存试验数据,无法判定检测结果,造成试验失败 操作规范:在对样品进行核酸提取和实时荧光扩增时要规范操作,防止样品的交叉污染、 酶的降解、假阳性的出现 离心管、***头和 PCR 管均需要高压灭菌或使用商品化的无 污染的离心管、***头和PCR 管。核酸提取结束后应立即进行仪器扩增,提取的核酸不可长时间置于室温,易受空气中酶的降解,短期可保存于 -20 ℃冰箱,长期应保存于-70 ℃冰箱
产生的 ΔRn 值也不同。请注意,荧光信号基线属于非模板依赖性因素,两种预混液的基线是不同的(图 3A)。Ct 值的变化并没有反映出反应系统的整体性能(图 3B)。灵敏度相当的预混液产生的 Ct ***值可能不同。
使用预混液 A 和预混液 B 在等量的人类 gDNA 中进行 RNase P 扩增。(A) Rn 根据循环数进行绘制,并且显示两个反应的基线。(B) 对数 (ΔRn) 根据循环数进行绘制。两种预混液的阈值(绿线)设定为相同水平。对于相同浓度的靶标而言,预混液 B 的 Ct 值 (CtB) 早于预混液 A 的相应值 (CtA),表明预混液 B 的基线较低。使用 Applied Biosystems™ 7500 实时荧光定量 PCR 系统执行所有扩增。
所说的PCR应该就是**常规的PCR,以DNA为模板,通过上下游引物,实现DNA的扩增。
2、RT-PCR一般情况下是指反转录PCR(reverse transcription),尽管有些资料上说实时荧光定量PCR也(realtime fluores-cence quantitative PCR)也简称RT-PCR,但是这是不对的,不推荐。
基本操作过程是将所提取的RNA进行反转录,然后将所获得的cDNA作为模板,设计引物进行扩增,是一种检测基因表达的常用方法。
3、实时荧光定量PCR也就是Real-Time PCR,其比较大的作用是检测样品中的初始DNA浓度。
至于三者的关系,RT-PCR和实时定量PCR应该都属于PCR,在RNA实验中,这二者都会应用到 北京**基因荧光定量PCR实验技术服务
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实时荧光定量PCR的应用
目前,qPCR技术已经广泛应用于生物医药食品等行业,应用于疾病的早期诊断、遗传病的早期诊断、***研究、**的诊断与研究、食品病原微生物的检测、转基因食品检测、动物疫病检测等,除此之外,还包括:
● 基因扩增
● 扩增特异性分析
● 基因定量分析
● 基因检测
● 基因分型
● SNP分析
● RFLP多态性分析
● 单/多基因表达研究
● 高通量基因表达谱研究
实时荧光定量PCR技术,顾名思义,就是在PCR的基础上加入荧光基团,通过荧光信号的变化的实时监测PCR的反应过程,***通过对未知模板进行定量分析的方法。 天津siRNA荧光定量PCR实验技术服务
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